そもそもメタルギアという作品でやる話じゃないのよね
MGS1のスネークにコード入力させるために敵が利用してたってのもそうだけど、それをやると敵は都合よく利用して今後を有利に展開させるために主人公を本気で排除しにこなくなるという矛盾が生まれる
だってPALキーを持っててPALの使い方を知ってるスネークがいなくなったらリキッドは核を撃てなくなっちゃうだろ？
ていうか司令室前でスネークの無線を盗聴した時点でスネーク殺してキー奪って自分で入力すれば？って話にもなるしメタルギアという作品でどんでん返しをやる理由になってないんよ

これを映画より上だと評するのならお前はただの小島秀夫の狂信者でしかないし、なんでもいいから映画を数本見てみろとしか言いようがない