基地の削除は、基地のコピュータを調べ(宇宙船への乗降ボタンと同じ)、メニューで「基地の削除」を選べば削除できる
削除する際に設置済みのパーツが残っていた場合、次回以降に再度基地を建てて基地復旧カプセルを設置することで "パーツを設置する際の素材の半分" が返って来る
このため面倒でなければ、またインベントリに空きスロットが十分にあるなら、既に設置したパーツは自分で削除して素材を回収した方がお得

他人の基地は基地のコンピュータを調べて通報すれば消える
クイックメニューから基地の報告を選んでも同様に消せる。宇宙ステーションからワープしてきたはいいけど地形と壁に閉じ込められた際はこっちで消す
自分以外には見えるし、基地内に建てられたパーツや機器は使える点が異なる

セーブ用ビーコンは資材に戻せない
ポータブル精製機と同様、回収ボタンまたは設置モードで削除ボタンを押すことで回収され、セーブ用ビーコンとしてインベントリに戻る
次回設置時は作成時に必要とした素材を消費せず、インベントリ内のセーブ用ビーコンを消費する