ゾナウは1000年前に滅びてる
ゾナウとゼルダが会話してる
ゾナウとゼルダはリンクと会えない状況にある

これゼルダ姫が1000年前にタイムスリップして戻れなくなってるんじゃない？
ゼルダ姫やゾナウからみて1000年後の現代にいるリンクに何かお助け要素を各地に残して、
それをプレイヤーがリンクとして見つけ出していく感じやろ