現時点で挙がっている情報だけから考えると、

「ポチタンが赤ちゃん化してタイムスリップ能力を失った設定は、当初案の『過去・現在・未来を何度も行き来する作品』から『基本的に1999年が舞台の作品』へ変更された際に追加された、あるいは強調された可能性はある」

とは言えますが、

「当初案では赤ちゃん化しなかった」
「当初案では能力を失わなかった」

と断定できる公式資料は、少なくともあなたが引用した内容からは確認できません。

むしろ考えられる可能性は複数あります。